کتاب بیوانفورماتیک آنالیز ساختار و توالی پروتئین ها , فاطمه سفید

کتاب بیوانفورماتیک آنالیز ساختار و توالی پروتئین ها (تعیین و ارزیابی ساختار دوم، سوم و توپولوژی پروتئین نقشه برداری اسید های آمینه عملکردی و اپیتوپ های سطحی) نوشته ی فاطمه سفید می باشد که توسط نشر باران بهار منتشر شده است.

در این کتاب سعی شده است تا ضمن بررسی نحوه دسترسی به توالی های های موجود در بانک اطلاعاتی NCBI، هم ترازی توالی ها و نیز شناسایی دمین ها و اسید آمینه های حفاظت شدن مورد بحث قرار گیرد. در بخش بعد به منظور تجزیه و تحلیل توالی و بررسی مشخصات فیزیکوشیمیایی پروتئین نرم افزار های متعددی را معرفی نمودیم. از آنجایی که موقعیت قرارگیری پروتئین های ایمونولوژیک پروتئین دارد، در این راستا جدیدترین نرم افزارهای موجود با انواع الگوریتم های پیش گویی و ارزیابی ساختار و محل اتصال لیگاند را مورد بحث قرار دادیم.

فهرست مطالب:

فصل 1: بررسی توالی های در دسترس و جستجو در بانک های اطلاعاتی

فصل 2: بررسی توالی های هومولوگ

فصل 3: همترازی

فصل 4: تجزیه و تحلیل اولیه توالی

فصل 5: شناسایی بپتید پروتئین

فصل 6: پیش بینی توپولوژی پروتئین

فصل 7: پیش بینی و بررسی ساختار دوم پروتئین

فصل 8: پیش بینی و بررسی ساختار سوم پروتئین

فصل 9: تعیین کیفیت و ارزیابی ساختار سوم پروتئین

فصل 10: تصحیح و بهبود ساختار سه بعدی پروتئین

و …